Os primeiros jardins botânicos, denominados hortus medicus, hortus academicus ou jardins de plantas medicinais, surgiram com o objectivo de auxiliarem o ensino da matéria médica e de fornecerem as boticas. Com a expansão geográfica europeia eles foram utilizados para o estudo botânico das novas espécies vegetais exóticas.
Cronologia
Século XVI
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- 1544 - Luca Ghini funda o Jardim botânico de Pisa.
- 1545 - Fundados o Jardim botânico de Pádua e o Jardim dos simples de Florença.
- 1568 - Ulisse Aldrovandi cria um jardim botânico em Bolonha.
- 1590 - A Universidade de Leiden é autorizada pelo burgomestre da cidade a estabelecer um hortus academicus, para cuja direcção é nomeado Charles de L'Écluse (1526-1609).
- 1593 - Henrique IV de França confia a Pierre Richer de Belleval, professor de botânica e anatomia em Montpellier, a criação de um Jardin Royal, inspirado no de Pádua.
- - Henricus Smetius, professor de medicina, cria o hortus medicus da Universidade de Heidelberg.
Século XVII
- 1600 - Fundado o Hortus Medicus de Copenhaga.
- 1621 - Fundado o Jardim botânico de Oxford.
- 1635 - Publicado o édito que cria o Jardin des plantes de Paris, com o nome de Jardin royal des plantes médicinales.
- 1655 - Olaus Rudbeck, professor de medicina na Universidade de Uppsala, inicia a plantação do que se tornará o Jardim de Lineu de Uppsala.
- 1673 - É estabelecido o Chelsea Physic Garden como Apothecaries’ Garden em Chelsea, Londres.
Século XVIII
- 1736 - Jardim botânico de Göttingen é fundado por Albrecht von Haller (1708-1777).
- 1768 - Começou a ser construído o Jardim Botânico da Ajuda.
- 1772 - Criado o Jardim botânico de Coimbra, no âmbito da reforma da Universidade.
- 1779 - A Accademia dei Regi Studi de Palermo institui uma catedra de "Botânica e Matéria médica", à qual atribui um terreno para plantar um jardim botânico.
Século XIX
- 1840 - Os jardins de Kew, em Londres, são adoptados como jardim botânico nacional, sob a direcção de William Hooker.
Jardins botânicos históricos
Jardins botânicos fundados até 1900. Ver também: Lista de Jardins Botânicos
Alemanha
Göttingen
Heidelberg
Dinamarca
Copenhaga
França
Montpellier
Paris
Grã-Bretanha
Londres
Oxford
Holanda
Leiden
- Jardim botânico de Leiden ou Hortus Botanicus Leiden
Itália

O jardim botânico de Pádua (ou Orto dei Semplici); ao fundo, a Basílica de Santo António.
Florença
Pádua
Palermo
Pisa
Portugal
Coimbra
Lisboa
Suécia
Uppsala
- Jardim botânico de Lineu em Uppsala ou Linnéträdgården.
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